生物體獲得能量的基本途徑是氧化還原反應(yīng),即通過電子供體和受體之間的電子傳遞釋放而來。在無氧條件下,硝酸鹽作為終端電子受體,在硝酸鹽還原酶(nitrate reductase;NaR)的存在下,進(jìn)行硝酸鹽還原反應(yīng),成為大多數(shù)微生物獲得能量的途徑之一。氮元素(nitrogen;N2)是生物體的生命元素,幫助參與產(chǎn)生蛋白質(zhì)、核酸等生物分子。所有氮循環(huán)(nitrogen cycle)中的還原反應(yīng)過程都包含通過硝酸鹽還原酶催化的硝酸鹽轉(zhuǎn)化為亞硝酸鹽的反應(yīng)。原核生物硝酸鹽還原酶是一種單核含鉬的氧化還原酶,其分為三種:以硝酸鹽為終端電子受體的呼吸異化型(respiratory dissimilatory;EC1.7.99.4)、周質(zhì)異化型(periplasmic dissimilatory;EC1.7.99.4)和參與硝酸鹽同化的同化型(assimilatory;EC1.9.6.1)硝酸鹽還原酶。同化型也存在于高等植物和藻類等,是由含Mo、黃素和正鐵血紅素的亞單位所構(gòu)成,分子內(nèi)具有小的電子遞體。細(xì)菌的電子供體主要為NADPH,可由硝酸鹽誘導(dǎo),可被氨和有機(jī)氮抑制。異化型酶存在于許多兼性好氧性細(xì)菌,多為與膜結(jié)構(gòu)結(jié)合,且不溶性。一般含鐵及鉬,以細(xì)胞色素為電子供體;而專性嫌氣性細(xì)菌產(chǎn)氣莢膜梭菌(Clostridium perfringens)的酶是可溶性的,以鐵氧還蛋白為電子供體。大腸桿菌硝酸鹽還原酶由4個142Kd和4個58Kd多肽構(gòu)成的復(fù)合結(jié)構(gòu),分子量為800Kd?;诘孜锵跛猁}(nitrate),在還原型甲基紫精(methyl viologen)(替代細(xì)胞色素)作為電子供體的參與下,通過異化型硝酸鹽還原酶(dissimilatory nitrate reductase;D-NaR)的催化作用,而還原為亞硝酸鹽,進(jìn)而通過格里斯試劑(Griess Reagent)氨苯磺胺(sulfanilamide)和N-(1-萘基)乙二胺二鹽酸鹽(N-(1-Naphthyl)ethylenediamine dihydrochloride;NED),在酸性條件下的重氮化(diazotization)反應(yīng),產(chǎn)生紫紅或粉紅色的偶氮化合物(Azo compound),通過其吸光峰值的變化(540nm波長),來定量分析異化型硝酸鹽還原酶的活性。其反應(yīng)方式為:
產(chǎn)品內(nèi)容
HEPENGBIO裂解液(Reagent A) 毫升
HEPENGBIO活性液(Reagent B) 微升
HEPENGBIO緩沖液(Reagent C) 毫升
HEPENGBIO反應(yīng)液(Reagent D) 微升
HEPENGBIO還原液(Reagent E1) 管
HEPENGBIO稀釋液(Reagent E2) 毫升
HEPENGBIO底物液(Reagent F) 毫升
HEPENGBIO顯色液(Reagent G) 毫升
HEPENGBIO標(biāo)準(zhǔn)液(Reagent H) 微升
產(chǎn)品說明書 1份
保存方式
保存HEPENGBIO活性液(Reagent B)、HEPENGBIO反應(yīng)液(Reagent D)和HEPENGBIO還原液(Reagent E)在-20℃冰箱里,其余的保存在4℃冰箱里;HEPENGBIO反應(yīng)液(Reagent D)和HEPENGBIO顯色液(Reagent G)避免光照;有效保證6月
用戶自備
15毫升錐形離心管:用于樣品操作
1.5毫升離心管:用于制備樣品和標(biāo)準(zhǔn)品的容器
微型臺式離心機(jī):用于樣品處理
恒溫水槽:用于反應(yīng)孵育
96孔板或比色皿:用于比色的容器
酶標(biāo)儀或分光光度儀:用于樣品比色分析
實驗步驟
實驗開始前,設(shè)定好分光光度儀或酶標(biāo)儀(溫度為25℃):波長540nm,并置零。然后進(jìn)行下列操作。
一、樣品準(zhǔn)備
選擇一:培養(yǎng)細(xì)菌
1. 準(zhǔn)備好500微升待測細(xì)菌(OD600=0.4至0.8,即1至2 X 107細(xì)胞/毫升)
2. 轉(zhuǎn)移到到1.5毫升離心管
3. 放進(jìn)4℃微型臺式離心機(jī)離心5分鐘,速度為1000g(或3500RPM,例如EPPENDORF 5415)
4. 小心抽去上清液
5. 加入xx微升HEPENGBIO裂解液(Reagent A),充分混勻
6. 加入xx微升HEPENGBIO活性液(Reagent B)
7. 強(qiáng)力渦旋震蕩15秒
8. 置于冰槽里15分鐘
9. 放進(jìn)4℃微型臺式離心機(jī)離心15分鐘,速度為16000g(或13000RPM,例如eppendorf 5415)
10. 小心移取500微升上清液到新的預(yù)冷的1.5毫升離心管
11. 移取10微升進(jìn)行蛋白定量檢測(注意:建議使用HEPENGBIO Bradford蛋白質(zhì)濃度定量試劑盒-HEPENGBIO30030.1)
12. 即刻放進(jìn)-70℃保存或置于冰槽里繼續(xù)后續(xù)操作
選擇二:細(xì)菌培養(yǎng)液
1. 移取1毫升細(xì)菌培養(yǎng)液到1.5毫升離心管
2. 放進(jìn)微型臺式離心機(jī)離心5分鐘,速度為16000g(或13000RPM,例如eppendorf 5415)
3. 小心移取1毫升上清液到新的預(yù)冷的1.5毫升離心管
4. 即刻放進(jìn)-70℃保存或置于冰槽里繼續(xù)后續(xù)操作
二、標(biāo)準(zhǔn)樣品配制
1. 準(zhǔn)備好5個1.5毫升離心管,標(biāo)記為1至5號管
2. 分別加入xx微升HEPENGBIO緩沖液(Reagent C)到2至5號管
3. 移取xx微升HEPENGBIO標(biāo)準(zhǔn)液(Reagent H)到1號管
4. 小心移取xx微升1號管的HEPENGBIO標(biāo)準(zhǔn)液(Reagent H)到2號管,混勻
5. 小心移取xx微升2號管稀釋的HEPENGBIO標(biāo)準(zhǔn)液(Reagent H)到3號管,混勻
6. 小心移取xx微升3號管稀釋的HEPENGBIO標(biāo)準(zhǔn)液(Reagent H)到4號管,混勻
7. 將1至5號管放進(jìn)冰槽里備用,避免光照;標(biāo)準(zhǔn)管濃度見下表
三、 標(biāo)準(zhǔn)曲線測定
1. 移取xx微升HEPENGBIO緩沖液(Reagent C)到新的比色皿
2. 加入xx微升上述配制的HEPENGBIO標(biāo)準(zhǔn)液(Reagent H)
3. 槍頭抽吸數(shù)次,混勻
4. 室溫下孵育20分鐘
5. 加入xx微升HEPENGBIO底物液(Reagent F)
6. 槍頭抽吸數(shù)次,混勻
7. 室溫下,孵育5分鐘
8. 加入xx微升HEPENGBIO顯色液(Reagent G)
9. 室溫下,孵育5分鐘,避免光照
10. 即刻放進(jìn)分光光度儀檢測:獲得吸光讀數(shù)
11. 重復(fù)實驗步驟1至10四次
12. 構(gòu)建標(biāo)準(zhǔn)曲線:縱座標(biāo)(Y軸)為吸光讀數(shù);橫座標(biāo)(X軸)為標(biāo)準(zhǔn)亞硝酸鹽濃度(微摩爾/升)
四、 樣品測定
測定開始前,將-20℃冰箱里的試劑盒中的HEPENGBIO還原液(Reagent E1)和HEPENGBIO稀釋液(Reagent E2)置于冰槽里融化,然后移出xx微升HEPENGBIO稀釋液(Reagent E2)到xx管HEPENGBIO還原液(Reagent E1),混勻后,置于冰槽里備用;用畢即刻放進(jìn)-70℃保存。再將-20℃冰箱里的試劑盒中的HEPENGBIO反應(yīng)液(Reagent D)置入冰槽里融化,然后移出40微升到新的1.5毫升離心管,加入xx微升上述配制的HEPENGBIO還原液(Reagent E),輕柔槍頭混勻后,置于冰槽里,標(biāo)記為HEPENGBIO反應(yīng)工作液,放在暗室里備用。然后進(jìn)行下列操作。
1. 移取xx微升HEPENGBIO緩沖液(Reagent C)到新的比色皿
2. 加入50微升上述準(zhǔn)備的待測樣品(注意:細(xì)菌裂解樣品為50微克蛋白)
3. 加入xx微升含有HEPENGBIO反應(yīng)液(Reagent D)和HEPENGBIO還原液(Reagent E)的HEPENGBIO反應(yīng)工作液
4. 槍頭抽吸數(shù)次,混勻
5. 室溫下孵育20分鐘(注意:細(xì)菌培養(yǎng)液上清樣品可以延長孵育至60分鐘)
6. 加入xx微升HEPENGBIO底物液(Reagent F)
7. 槍頭抽吸數(shù)次,混勻
8. 室溫下孵育5分鐘
9. 加入xx微升HEPENGBIO顯色液(Reagent G)
10. 室溫下孵育5分鐘,避免光照
11. 即刻放進(jìn)分光光度儀檢測:獲得吸光讀數(shù)
12. 根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)曲線獲得樣品對應(yīng)亞硝酸鹽濃度(微摩爾/升)
13. 樣品活性計算:
五、 酶標(biāo)儀測定
1. 在96孔板上做好相應(yīng)標(biāo)記:標(biāo)準(zhǔn)樣品和待測樣品
2. 分別移取xx微升HEPENGBIO緩沖液(Reagent C)到所有孔里
3. 分別加入xx微升上述配制的HEPENGBIO標(biāo)準(zhǔn)液(Reagent H)或待測樣品(注意:細(xì)菌裂解樣品為50微克蛋白)到相應(yīng)孔里
4. 加入xx微升含有HEPENGBIO反應(yīng)液(Reagent D)和HEPENGBIO還原液(Reagent E)的HEPENGBIO反應(yīng)工作液到待測樣品孔里
5. 加入xx微升HEPENGBIO緩沖液(Reagent C)到標(biāo)準(zhǔn)樣品孔
6. 輕輕搖動96孔板
7. 室溫下孵育20分鐘(注意:細(xì)菌培養(yǎng)液上清樣品可以延長孵育至60分鐘)
8. 加入xx微升HEPENGBIO底物液(Reagent F)到所有孔里
9. 輕輕搖動96孔板
10. 室溫下孵育5分鐘
11. 加入xx微升HEPENGBIO顯色液(Reagent G)到所有孔里
12. 輕輕搖動96孔板
13. 室溫下孵育5分鐘
14. 即刻放進(jìn)酶標(biāo)儀檢測:獲得吸光讀數(shù)
15. 構(gòu)建標(biāo)準(zhǔn)曲線:縱座標(biāo)(Y軸)為吸光讀數(shù);橫座標(biāo)(X軸)為標(biāo)準(zhǔn)亞硝酸鹽濃度(微摩爾/升)
16. 根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)曲線獲得樣品對應(yīng)亞硝酸鹽濃度(微摩爾/升)
17. 樣品活性計算:
產(chǎn)品內(nèi)容
HEPENGBIO裂解液(Reagent A) 毫升
HEPENGBIO活性液(Reagent B) 微升
HEPENGBIO緩沖液(Reagent C) 毫升
HEPENGBIO反應(yīng)液(Reagent D) 微升
HEPENGBIO還原液(Reagent E1) 管
HEPENGBIO稀釋液(Reagent E2) 毫升
HEPENGBIO底物液(Reagent F) 毫升
HEPENGBIO顯色液(Reagent G) 毫升
HEPENGBIO標(biāo)準(zhǔn)液(Reagent H) 微升
產(chǎn)品說明書 1份
保存方式
保存HEPENGBIO活性液(Reagent B)、HEPENGBIO反應(yīng)液(Reagent D)和HEPENGBIO還原液(Reagent E)在-20℃冰箱里,其余的保存在4℃冰箱里;HEPENGBIO反應(yīng)液(Reagent D)和HEPENGBIO顯色液(Reagent G)避免光照;有效保證6月
用戶自備
15毫升錐形離心管:用于樣品操作
1.5毫升離心管:用于制備樣品和標(biāo)準(zhǔn)品的容器
微型臺式離心機(jī):用于樣品處理
恒溫水槽:用于反應(yīng)孵育
96孔板或比色皿:用于比色的容器
酶標(biāo)儀或分光光度儀:用于樣品比色分析
實驗步驟
實驗開始前,設(shè)定好分光光度儀或酶標(biāo)儀(溫度為25℃):波長540nm,并置零。然后進(jìn)行下列操作。
一、樣品準(zhǔn)備
選擇一:培養(yǎng)細(xì)菌
1. 準(zhǔn)備好500微升待測細(xì)菌(OD600=0.4至0.8,即1至2 X 107細(xì)胞/毫升)
2. 轉(zhuǎn)移到到1.5毫升離心管
3. 放進(jìn)4℃微型臺式離心機(jī)離心5分鐘,速度為1000g(或3500RPM,例如EPPENDORF 5415)
4. 小心抽去上清液
5. 加入xx微升HEPENGBIO裂解液(Reagent A),充分混勻
6. 加入xx微升HEPENGBIO活性液(Reagent B)
7. 強(qiáng)力渦旋震蕩15秒
8. 置于冰槽里15分鐘
9. 放進(jìn)4℃微型臺式離心機(jī)離心15分鐘,速度為16000g(或13000RPM,例如eppendorf 5415)
10. 小心移取500微升上清液到新的預(yù)冷的1.5毫升離心管
11. 移取10微升進(jìn)行蛋白定量檢測(注意:建議使用HEPENGBIO Bradford蛋白質(zhì)濃度定量試劑盒-HEPENGBIO30030.1)
12. 即刻放進(jìn)-70℃保存或置于冰槽里繼續(xù)后續(xù)操作
選擇二:細(xì)菌培養(yǎng)液
1. 移取1毫升細(xì)菌培養(yǎng)液到1.5毫升離心管
2. 放進(jìn)微型臺式離心機(jī)離心5分鐘,速度為16000g(或13000RPM,例如eppendorf 5415)
3. 小心移取1毫升上清液到新的預(yù)冷的1.5毫升離心管
4. 即刻放進(jìn)-70℃保存或置于冰槽里繼續(xù)后續(xù)操作
二、標(biāo)準(zhǔn)樣品配制
1. 準(zhǔn)備好5個1.5毫升離心管,標(biāo)記為1至5號管
2. 分別加入xx微升HEPENGBIO緩沖液(Reagent C)到2至5號管
3. 移取xx微升HEPENGBIO標(biāo)準(zhǔn)液(Reagent H)到1號管
4. 小心移取xx微升1號管的HEPENGBIO標(biāo)準(zhǔn)液(Reagent H)到2號管,混勻
5. 小心移取xx微升2號管稀釋的HEPENGBIO標(biāo)準(zhǔn)液(Reagent H)到3號管,混勻
6. 小心移取xx微升3號管稀釋的HEPENGBIO標(biāo)準(zhǔn)液(Reagent H)到4號管,混勻
7. 將1至5號管放進(jìn)冰槽里備用,避免光照;標(biāo)準(zhǔn)管濃度見下表
管號 | HEPENGBIO緩沖液(Reagent C) | HEPENGBIO標(biāo)準(zhǔn)液(Reagent H) | 標(biāo)準(zhǔn)亞硝酸鹽濃度 |
1 | - | xx微升 | xx微摩爾/升 |
2 | xx微升 | xx微升1號管 | xx微摩爾/升 |
3 | xx微升 | xx微升2號管 | xx微摩爾/升 |
4 | xx微升 | xx微升3號管 | xx微摩爾/升 |
5 | xx微升 | 0 | 0 |
三、 標(biāo)準(zhǔn)曲線測定
1. 移取xx微升HEPENGBIO緩沖液(Reagent C)到新的比色皿
2. 加入xx微升上述配制的HEPENGBIO標(biāo)準(zhǔn)液(Reagent H)
3. 槍頭抽吸數(shù)次,混勻
4. 室溫下孵育20分鐘
5. 加入xx微升HEPENGBIO底物液(Reagent F)
6. 槍頭抽吸數(shù)次,混勻
7. 室溫下,孵育5分鐘
8. 加入xx微升HEPENGBIO顯色液(Reagent G)
9. 室溫下,孵育5分鐘,避免光照
10. 即刻放進(jìn)分光光度儀檢測:獲得吸光讀數(shù)
11. 重復(fù)實驗步驟1至10四次
12. 構(gòu)建標(biāo)準(zhǔn)曲線:縱座標(biāo)(Y軸)為吸光讀數(shù);橫座標(biāo)(X軸)為標(biāo)準(zhǔn)亞硝酸鹽濃度(微摩爾/升)
四、 樣品測定
測定開始前,將-20℃冰箱里的試劑盒中的HEPENGBIO還原液(Reagent E1)和HEPENGBIO稀釋液(Reagent E2)置于冰槽里融化,然后移出xx微升HEPENGBIO稀釋液(Reagent E2)到xx管HEPENGBIO還原液(Reagent E1),混勻后,置于冰槽里備用;用畢即刻放進(jìn)-70℃保存。再將-20℃冰箱里的試劑盒中的HEPENGBIO反應(yīng)液(Reagent D)置入冰槽里融化,然后移出40微升到新的1.5毫升離心管,加入xx微升上述配制的HEPENGBIO還原液(Reagent E),輕柔槍頭混勻后,置于冰槽里,標(biāo)記為HEPENGBIO反應(yīng)工作液,放在暗室里備用。然后進(jìn)行下列操作。
1. 移取xx微升HEPENGBIO緩沖液(Reagent C)到新的比色皿
2. 加入50微升上述準(zhǔn)備的待測樣品(注意:細(xì)菌裂解樣品為50微克蛋白)
3. 加入xx微升含有HEPENGBIO反應(yīng)液(Reagent D)和HEPENGBIO還原液(Reagent E)的HEPENGBIO反應(yīng)工作液
4. 槍頭抽吸數(shù)次,混勻
5. 室溫下孵育20分鐘(注意:細(xì)菌培養(yǎng)液上清樣品可以延長孵育至60分鐘)
6. 加入xx微升HEPENGBIO底物液(Reagent F)
7. 槍頭抽吸數(shù)次,混勻
8. 室溫下孵育5分鐘
9. 加入xx微升HEPENGBIO顯色液(Reagent G)
10. 室溫下孵育5分鐘,避免光照
11. 即刻放進(jìn)分光光度儀檢測:獲得吸光讀數(shù)
12. 根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)曲線獲得樣品對應(yīng)亞硝酸鹽濃度(微摩爾/升)
13. 樣品活性計算:
五、 酶標(biāo)儀測定
1. 在96孔板上做好相應(yīng)標(biāo)記:標(biāo)準(zhǔn)樣品和待測樣品
2. 分別移取xx微升HEPENGBIO緩沖液(Reagent C)到所有孔里
3. 分別加入xx微升上述配制的HEPENGBIO標(biāo)準(zhǔn)液(Reagent H)或待測樣品(注意:細(xì)菌裂解樣品為50微克蛋白)到相應(yīng)孔里
4. 加入xx微升含有HEPENGBIO反應(yīng)液(Reagent D)和HEPENGBIO還原液(Reagent E)的HEPENGBIO反應(yīng)工作液到待測樣品孔里
5. 加入xx微升HEPENGBIO緩沖液(Reagent C)到標(biāo)準(zhǔn)樣品孔
6. 輕輕搖動96孔板
7. 室溫下孵育20分鐘(注意:細(xì)菌培養(yǎng)液上清樣品可以延長孵育至60分鐘)
8. 加入xx微升HEPENGBIO底物液(Reagent F)到所有孔里
9. 輕輕搖動96孔板
10. 室溫下孵育5分鐘
11. 加入xx微升HEPENGBIO顯色液(Reagent G)到所有孔里
12. 輕輕搖動96孔板
13. 室溫下孵育5分鐘
14. 即刻放進(jìn)酶標(biāo)儀檢測:獲得吸光讀數(shù)
15. 構(gòu)建標(biāo)準(zhǔn)曲線:縱座標(biāo)(Y軸)為吸光讀數(shù);橫座標(biāo)(X軸)為標(biāo)準(zhǔn)亞硝酸鹽濃度(微摩爾/升)
16. 根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)曲線獲得樣品對應(yīng)亞硝酸鹽濃度(微摩爾/升)
17. 樣品活性計算: